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Primers

Diluting primers

Reconstituting lyophilized primers to create 100X stock:
Resuspend to 100 uM/L concentration: for 28.5 nM of lyophilized primer, add 285 ul water (10 times more, in uL).

Dilute to make working solution :
To 10uL of the working stock above, add 90 uL of water, to make 10 uM/L (or 10 pM/ul) solution.

Working concentration: Use 1uL of the working solution above in 25uL reaction (10/25=0.4pM per rxn).

 

Primers we use

gene primer code seq
16S 1492R GGTTACCTTGTTACGACTT
16S 27F 5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG
16S bact rev 338R 5′-TGCTGCCTCCCGTAGGAGT Amann et al. 1995. Microbiol. Rev. 59, 143–169.
16S bact+archaea for 515F 5′-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA Bergmann et al 2011 (Fierer lab)
16S bact+archaea rev 806R 5-GGACTACVSGGGTATCTAAT Bergmann et al 2011 (Fierer lab)
cellobiohydrolase fungCBH1f
cellobiohydrolase fungCBH1r
efTu 52F Ludwig et al
ITS (end of SSU) ITS1 TCCGTAGGTGAACCTGCGG
ITS (in 5.8S, for) ITS3 GCATCGATGAAGAACGCAGC
ITS (in 5.8S, rev) ITS2 GCTGCGTTCTTCATCGATGC
ITS (rev, start of LSU) ITS4 TCCTCCGCTTATTGATATGC
ITS fungal (like ITS1, basidio) ITS1-F CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA
SSU (18S) general NS1 GTAGTCATATGCTTGTCTC eukaryotes?
SSU rev NS2 GGCTGCTGGCACCAGACTTGC 550 in S. cerevisiae; eukaryotes?
SSU (18S) general NS4 CTTCCGTCAATTCCTTTAAG eukaryotes?
SSU fungal AU2 5′-TTTCGATGGTAGGATAGDGG Vandenkoornhuyse et al. 2002, Science 295:2051
SSU fungal AU4 5′-RTCTCACTAAGCCATTC Vandenkoornhuyse et al. 2002, Science 295:2051
SSU fungal JH-SSU-304 5′-CCCTATCAACTTTCGATG upstream of AU2, 2bp difference from Curculionidae, can use with NS2 for 240bp conserved product or with JH-SSU-822 for ~500bp of variable product
SSU fungal (rev) JH-SSU-822 5′-CTAGAAACCAACAAAATAG 2bp upstream of SR4, 4bp difference from Curculionidae
SSU fungal (rev) JH-SSU-1646 5′-CTAAGCCATTCAATCGGTA 6bp upstream of AU4, 2bp difference from Curculionidae
LSU (28S) LR0R 5′-ACCCGCTGAACTTAAGC identical in insect and fungi
LSU (28S) rev LR2 5′-TTTTCAAAGTTCTTTTC White et al., from yeast, 1bp difference from filamentous ascos
LSU (28S) rev LR3 5′-CCGTGTTTCAAGACGGG identical for beetles and fungi
LSU (28S) JH-LSU-91 5′-AGTAACGGCGAGTGAAG probably universal for fungi, not for insect, position 91 in S. cerevisiae 28S
LSU (28S) rev JH-LSU-377 5′-TTTTCAAAGTGCTTTTC almost identical to LR2 but with one bp more specific to filamentous ascos, position 377 in S. cerevisiae; doesn’t work very well
LSU (28S) rev JH-LSU-638 5′-GGTCCGTGTTTCAAGAC reverse complement to Vilgalis’s LR3R (which is not the same as reverse complement of LR3)
LSU (28S) rev JH-LSU-643 5′-CTCCTTGGTCCGTGTTTC tested with Raffaelea spp., inconsistent product
LSU (28S) rev JH-LSU-830 5′-GTTTCCTCTGGCTTCACCC tested with Raffaelea spp., inconsistent product

R= A G (purine) D= G A T

Buying primers

ITS1 example CType: DNA Oligos – modified & non-modified
Oligo Name: …
Synthesis Scale: 0.025 µmol
Purification: Desalt
Sequence (5′ to 3′): …
Format: Lab-ready
Number of Tubes per Oligo: 1
Concentration (µM): NA

454 primers – NO LONGER IN USE

From IDT: to get reaction-ready concentration, get 1nm in 100uL (concentration: 10)
Old FLX chemistry Fungi.

454 primer Bar Code linker template primer primer name concatenated ordered
GCCTTGCCAGCCCGCTCAG none TC AGTAACGGCGAGTGAAG JH-LSU-091-454B GCCTTGCCAGCCCGCTCAGTCAGTAACGGCGAGTGAAG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG AACTCGTCGATG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-201 GCCTCCCTCGCGCCATCAGAACTCGTCGATGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG AACTGTGCGTAC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-202 GCCTCCCTCGCGCCATCAGAACTGTGCGTACAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG AAGAGATGTCGA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-203 GCCTCCCTCGCGCCATCAGAAGAGATGTCGAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG AAGCTGCAGTCG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-204 GCCTCCCTCGCGCCATCAGAAGCTGCAGTCGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG AATCAGTCTCGT AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-205 GCCTCCCTCGCGCCATCAGAATCAGTCTCGTAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG AATCGTGACTCG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-206 GCCTCCCTCGCGCCATCAGAATCGTGACTCGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACACACTATGGC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-207 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACACACTATGGCAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACACATGTCTAC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-208 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACACATGTCTACAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACACGAGCCACA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-209 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACACGAGCCACAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACACGGTGTCTA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-210 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACACGGTGTCTAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACACTAGATCCG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-211 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACACTAGATCCGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACACTGTTCATG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-212 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACACTGTTCATGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACAGACCACTCA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-213 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACAGACCACTCAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACAGAGTCGGCT AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-214 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACAGAGTCGGCTAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACAGCAGTGGTC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-215 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACAGCAGTGGTCAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACAGCTAGCTTG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-216 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACAGCTAGCTTGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACAGTGCTTCAT AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-217 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACAGTGCTTCATAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACAGTTGCGCGA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-218 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACAGTTGCGCGAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACATCACTTAGC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-219 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACATCACTTAGCAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACATGATCGTTC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-220 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACATGATCGTTCAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACATGTCACGTG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-221 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACATGTCACGTGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACATTCAGCGCA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-222 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACATTCAGCGCAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACCACATACATC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-223 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACCACATACATCAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACCAGACGATGC AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-224 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACCAGACGATGCAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACCAGCGACTAG AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-225 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACCAGCGACTAGAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACCGCAGAGTCA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-226 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACCGCAGAGTCAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACCTCGATCAGA AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-227 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACCTCGATCAGAAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011
GCCTCCCTCGCGCCATCAG ACCTGTCTCTCT AG CCGTGTTTCAAGACGGG LR3-454A-228 GCCTCCCTCGCGCCATCAGACCTGTCTCTCTAGCCGTGTTTCAAGACGGG 20-Aug-2011

Old FLX chemistry bacteria and archaea.

454 primer Bar Code linker template primer primer name
FLA B primer: GCCTTGCCAGCCCGCTCAG none GA GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806R-454B-2012Feb
FLX A primer: GCCTCCCTCGCGCCATCAG various CC GGACTACVSGGGTATCTAAT 515f-454A-2012Feb-well_position

Barcodes on 515R primer ordered on Feb 06 2012 (order “515F-806R-454barcoded”). R primer mixed with each barcoded F primer.

A1 GTAGTGTCTAGC
A2 GTCGCTGTCTTC
A3 GTGAGGTCGCTA
A4 GTTGACGACAGC
A5 GTCACGACTATT
A6 GTCTGACAGTTG
A7 GTGTGCTATCAG
A8 TACAGATGGCTC
A9 TACTTACTGCAG
A10 GGATCGCAGATC
A11 GTAGACTGCGTG
A12 GTCAACGCGATG
B1 GTCTCTCTACGC
B2 GTGTCTACATTG
B3 GTATGTTGCTCA
B4 GTCTCATGTAGG
B5 GTGTACCTATCA
B6 TAGCTGAGTCCA
B7 GGCGACATGTAC
B8 GTAGATGCTTCG
B9 GGTGCGTGTATG
B10 GCTTACATCGAG
B11 GTATCCATGCGA
B12 TAACTCTGATGC
C1 TACTAATCTGCG
C2 TAGCCTCTCTGC
C3 GCTTGCGAGACA
C4 GTCATATCGTAC
C5 GTACGGCATACG
C6 GTATGCGCTGTA
C7 GTCTATCGGAGT
C8 GTGGCGATACAC
C9 TACACGATCTAC
C10 TACTGGACGCGA
C11 TAGCTCGTAACT
C12 GGCAGTGTATCG
D1 GTAGAGCTGTTC
D2 GCTTCATAGTGT
D3 TAACAGTCGCTG
D4 TACGTGTACGTG
D5 TAGCATCGTGGT
D6 GTACAAGAGTGA
D7 TACGCGCTGAGA
D8 TAGATCCTCGAT
D9 GCTGTGTAGGAC
D10 GGTCGTAGCGTA
D11 GTCTGGATAGCG
D12 GTGTGTGTCAGG
E1 TACAGTCTCATG
E2 TACTTCGCTCGC
E3 TAGGTATCTCAC
E4 GTCGTAGCCAGA
E5 GCTGTAGTATGC
E6 GGTCACTGACAG
E7 GTGATAGTGCCG
E8 GTATATCCGCAG
E9 GTCATTCACGAG
E10 GTCTTCGTCGCT
E11 GTGTTGCAGCAT
E12 TACATCACCACA
F1 TAGACTGTACTC
F2 GTAGCGCGAGTT
F3 GTCCATAGCTAG
F4 TAGTCGTCTAGT
F5 GGCTATGACATC
F6 GTGACCTGATGT
F7 TAGTGCTGCGTA
F8 GGTATACGCAGC
F9 GTAGCTGACGCA
F10 GTCGACTCCTCT
F11 GTGACTGCGGAT
F12 GTTCGCGTATAG
G1 TACGATGACCAC
G2 TAGATAGCAGGA
G3 TAGTGTGCTTCA
G4 GTTAGAGCACTC
G5 TACCGCTAGTAG
G6 TAGAGAGAGTGG
G7 TAAGCGCAGCAC
G8 TACTACATGGTC
G9 TAGCGACATCTG
G10 GGACGTCACAGT
G11 GTACTCTAGACT
G12 TACACACATGGC
H1 TACTGCGACAGT
H2 TAGCGGATCACG
H3 GTATGACTGGCT
H4 GTCTACACACAT
H5 GTGCACATTATC
H6 GGCGTACTGATG
H7 GTAGCAACGTCT
H8 TAGCACACCTAT
H9 TACGGTATGTCT
H10 GTTGTATACTCG
H11 GTCGTGTGTCAA
H12 GTGCAATCGACG

The complete order, including the barcodes above:

well oligo1 oligo2_to_the_same_well
A1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTAGTGTCTAGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCGCTGTCTTCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGAGGTCGCTACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTTGACGACAGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCACGACTATTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCTGACAGTTGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGTGCTATCAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACAGATGGCTCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACTTACTGCAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGATCGCAGATCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTAGACTGCGTGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
A12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCAACGCGATGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCTCTCTACGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGTCTACATTGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTATGTTGCTCACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCTCATGTAGGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGTACCTATCACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGCTGAGTCCACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGCGACATGTACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTAGATGCTTCGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGTGCGTGTATGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGCTTACATCGAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTATCCATGCGACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
B12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAACTCTGATGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACTAATCTGCGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGCCTCTCTGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGCTTGCGAGACACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCATATCGTACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTACGGCATACGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTATGCGCTGTACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCTATCGGAGTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGGCGATACACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACACGATCTACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACTGGACGCGACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGCTCGTAACTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
C12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGCAGTGTATCGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTAGAGCTGTTCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGCTTCATAGTGTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAACAGTCGCTGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACGTGTACGTGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGCATCGTGGTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTACAAGAGTGACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACGCGCTGAGACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGATCCTCGATCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGCTGTGTAGGACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGTCGTAGCGTACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCTGGATAGCGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
D12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGTGTGTCAGGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACAGTCTCATGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACTTCGCTCGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGGTATCTCACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCGTAGCCAGACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGCTGTAGTATGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGTCACTGACAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGATAGTGCCGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTATATCCGCAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCATTCACGAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCTTCGTCGCTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGTTGCAGCATCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
E12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACATCACCACACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGACTGTACTCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTAGCGCGAGTTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCCATAGCTAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGTCGTCTAGTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGCTATGACATCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGACCTGATGTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGTGCTGCGTACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGTATACGCAGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTAGCTGACGCACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCGACTCCTCTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGACTGCGGATCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
F12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTTCGCGTATAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACGATGACCACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGATAGCAGGACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGTGTGCTTCACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTTAGAGCACTCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACCGCTAGTAGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGAGAGAGTGGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAAGCGCAGCACCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACTACATGGTCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGCGACATCTGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGACGTCACAGTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTACTCTAGACTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
G12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACACACATGGCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H1 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACTGCGACAGTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H2 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGCGGATCACGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H3 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTATGACTGGCTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H4 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCTACACACATCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H5 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGCACATTATCCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H6 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGGCGTACTGATGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H7 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTAGCAACGTCTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H8 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTAGCACACCTATCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H9 GCCTCCCTCGCGCCATCAGTACGGTATGTCTCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H10 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTTGTATACTCGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H11 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTCGTGTGTCAACCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA
H12 GCCTCCCTCGCGCCATCAGGTGCAATCGACGCCGGACTACVSGGGTATCTAAT GCCTTGCCAGCCCGCTCAGGAGTGCCAGCMGCCGCGGTAA

 

Titanium Lib-a chemistry, NOT YET USED, need to confirm correctness. Fungal LSU primers. Four-bp multiplex identifiers (MIDs). Only one-directional sequencing needed, from the more variable 3′ end, so only B adapters have multiple MIDs attached.

adaptor adaptor seq key MID name mid our primer 5-3′ direction name
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL091 CGTACAGATAT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-091
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL092 CGTAGCTCTCT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-092
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL093 CGTATAGTGCT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-093
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL094 CGTCAGCGACT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-094
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL095 CGTCGCAGTGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-095
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL096 CGTCTCACGAT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-096
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL097 CGTGACTCAGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-097
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL098 CTACACGCTCT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-098
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL099 CTACGATATGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-099
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL100 CTAGACAGACT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-100
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL101 CTAGTACTCAT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-101
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL102 CTATATGTCGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-102
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL103 CTATCGACACT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-103
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL104 CTATGTAGAGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-104
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL105 CTCACGTACAT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-105
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL106 CTCGAGTCTCT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-106
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL107 CTCGTCGAGAT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-107
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL108 CTCTACAGCGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-108
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL109 CTGTCGTGCGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-109
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL110 CTGTGACGTGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-110
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL111 GACGCTGTCGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-111
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL112 GACGTATGACT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-112
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL113 GACTAGCTAGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-113
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL114 GAGACGTCGCT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-114
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL115 GAGAGAGACGT CCGTGTTTCAAGACGGG rev LR3-454B-115
A CGTATCGCCTCCCTCGCGCCA TCAG no mid no mid AGTAACGGCGAGTGAAG for JH-LSU-091-454A
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL091 CGTACAGATAT GTAGTCATATGCTTGTCTC rev NS1-454B-RL091
A CGTATCGCCTCCCTCGCGCCA TCAG no mid no mid GGCTGCTGGCACCAGACTTGC for NS2-454A

Again – Titanium Lib-A chemistry, not yet tested, Bacterial primers.

adaptor adaptor seq key MID name mid our primer 5-3′ direction name
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL001 AGTCGTGGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-001
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL002 ATACTAGGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-002
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL003 ACGAGTGGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-003
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL004 ATACGTGGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-004
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL005 AGTCTACGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-005
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL006 ACTAGAGGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-006
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL007 AGTGTGTGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-007
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL008 ACACAGTGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-008
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL009 ACGATCTGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-009
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL010 AGAGACGGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-010
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL011 ACTCGTAGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-011
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL012 ACGACGGGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-012
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL013 ACGTCGGGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-013
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL014 ACTCTCGGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-014
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL015 ATAGTAGGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-015
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL016 AGACGTCGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-016
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL017 AGTGTAGGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-017
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL018 ACTACTAGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-018
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL019 ACGTATAGTAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-019
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL020 AGTACGTGCTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-020
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL021 ACGCGTGGTCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-021
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL022 AGTACTGGTCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-022
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL023 ACGTAGTGTCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-023
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL024 ATCGACGGACG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-024
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL025 ACTACGGGTAG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-025
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL026 ACGTACGGTAC TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-026
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL027 ATACGTAGGAC TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-027
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL028 ACGTCGTGCAC TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-028
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL029 ACTCACGGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-029
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL030 AGTATGGGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-030
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL031 ACGCTGTGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-031
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL032 ATATAGTGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-032
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL033 AGAGTCTGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-033
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL034 ACACGAGGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-034
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL035 ATCGACAGTGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-035
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL036 AGCGCGCGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-036
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL037 ACACTCAGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-037
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL038 ATCTCTGGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-038
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL039 AGAGAGGGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-039
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL040 ATCAGCGGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-040
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL041 ATGCTAGGCGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-041
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL042 ATATCACGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-042
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL043 ACAGTGGGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-043
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL044 AGCTAGGGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-044
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL045 ATATATGGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-045
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL046 ACGAGATGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-046
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL047 AGTACAGGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-047
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL048 AGCGCTAGAGT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-048
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL049 AGTGAGGGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-049
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL050 ACTATAGGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-050
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL051 AGATCAGGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-051
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL052 ATCTGTAGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-052
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL053 AGAGATAGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-053
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL054 ACAGCGTGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-054
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL055 AGACTAGGTCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-055
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL056 ACTACGCGGCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-056
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL057 ACTCGTGGGCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-057
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL058 ACGCACAGGCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-058
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL059 AGTATCTGGCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-059
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL060 AGTCGACGGCT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-060
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL061 ACGTGCAGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-061
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL062 ATAGCGGGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-062
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL063 ACAGACGGACT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-063
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL064 ATCGTGGGTAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-064
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL065 AGCACGGGTAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-065
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL066 AGTGCTGGTAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-066
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL067 ACTAGCTGTAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-067
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL068 ATACTCTGTAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-068
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL069 ACGTGAGGGAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-069
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL070 AGACTGAGGAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-070
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL071 ATACGAGGGAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-071
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL072 ACGTCTCGGAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-072
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL073 AGACGTGGCAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-073
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL074 AGTAGTCGCAT TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-074
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL075 ACTGTCTGGTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-075
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL076 AGACTCGGGTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-076
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL077 ATCGTAGGGTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-077
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL078 ATATACAGGTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-078
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL079 ACATCGTGGTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-079
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL080 AGAGTATGGTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-080
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL081 ACAGTAGGCTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-081
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL082 ACTAGAGGCTG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-082
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL083 ACGCGACGATG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-083
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL084 ATAGTGTGTCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-084
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL085 ACACACTGTCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-085
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL086 ACGATGAGTCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-086
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL087 ATATACGGTCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-087
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL088 AGCGTACGGCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-088
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL089 ATACGATGGCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-089
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL090 AGTATAGGGCG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-090
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL091 ATATCTGGACG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-091
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL092 AGAGAGCGACG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-092
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL093 AGCACTAGACG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-093
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL094 AGTCGCGGACG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-094
B CTATGCGCCTTGCCAGCCCGC TCAG RL095 ACACTGGGACG TGCTGCCTCCCGTAGGAGT rev 338r-454B-095
B CGTATCGCCTCCCTCGCGCCA TCAG no mid no mid, same for all AGAGTTTGATCCTGGCTCAG for 27f-454A

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